輸卵管囊腫可能引發疼痛癥狀。較小的囊腫通常沒有明顯不適，多數人在體檢時偶然發現。當囊腫體積逐漸增大超過一定程度，或者合并炎癥感染時，可能壓迫周圍組織或神經，導致下腹出現墜脹感或者隱痛，這種疼痛在活動后或者同房過程中可能加重。

如果囊腫發生扭轉，會突然出現劇烈腹痛，還可能伴有惡心嘔吐，情況嚴重時甚至會導致休克，需要立刻前往醫院進行手術治療。慢性疼痛也可能是囊腫刺激盆腔腹膜或者合并盆腔粘連的表現。若長時間存在不明原因的下腹痛，特別是同時有白帶異常或者月經紊亂的情況，建議通過超聲檢查排查是否存在輸卵管囊腫，避免耽誤治療。